9月15日，真邁生物與序禎達(dá)生物、UST共同簽署協(xié)議，正式達(dá)成戰(zhàn)略合作。根據(jù)協(xié)議，序禎達(dá)生物將采用UST的TELL-Seq關(guān)聯(lián)長(zhǎng)讀長(zhǎng)二代測(cè)序技術(shù)，并通過(guò)真邁生物的GenoLab M高通量基因測(cè)序平臺(tái)，推出經(jīng)濟(jì)可及的長(zhǎng)讀長(zhǎng)測(cè)序解決方案，為廣大合作伙伴提供高品質(zhì)的檢測(cè)分析服務(wù)。作為此次戰(zhàn)略合作的第一個(gè)重量級(jí)成果，三方聯(lián)合推出的「細(xì)菌基因組完成圖-NGS躍級(jí)版」今日發(fā)布。
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細(xì)菌基因組完成圖-NGS躍級(jí)版
組裝細(xì)菌完整基因組是現(xiàn)代微生物研究的重要手段。利用細(xì)菌基因組完成圖可以更好地研究重要基因功能、鑒定未知功能基因以及比較物種間的進(jìn)化關(guān)系，這在傳染性疾病的研究、預(yù)防與治療，環(huán)境微生物研究及疫苗和抗生物等的研究開(kāi)發(fā)中都發(fā)揮著重要作用。
序禎達(dá)生物采用UST的TELL-Seq關(guān)聯(lián)長(zhǎng)讀長(zhǎng)二代測(cè)序技術(shù)，結(jié)合真邁生物的GenoLab M高通量基因測(cè)序平臺(tái)，打造出一款通過(guò)二代測(cè)序平臺(tái)即能接近三代組裝效果的全新產(chǎn)品——細(xì)菌基因組完成圖-NGS躍級(jí)版。
丨長(zhǎng)讀長(zhǎng)二代測(cè)序技術(shù)讓細(xì)菌基因組完成圖繪制觸手可及
細(xì)菌基因組完成圖-NGS躍級(jí)版采用了關(guān)聯(lián)長(zhǎng)讀長(zhǎng)二代測(cè)序技術(shù)——TELL-Seq，該技術(shù)通過(guò)轉(zhuǎn)座酶對(duì)來(lái)自同一條長(zhǎng)DNA的小片段進(jìn)行特定標(biāo)記，利用標(biāo)記對(duì)短讀長(zhǎng)序列進(jìn)行拼接，讓二代測(cè)序的短讀長(zhǎng)數(shù)據(jù)產(chǎn)生超長(zhǎng)讀長(zhǎng)測(cè)序效果，等價(jià)讀長(zhǎng)達(dá)20 kb-200 kb。經(jīng)過(guò)創(chuàng)新開(kāi)發(fā)的生信算法，組裝的平均效果為contig(>10kb)：1-10個(gè)；N50：2-5Mb（與基因組大小關(guān)聯(lián)）。
該技術(shù)不僅可用于微生物de novo測(cè)序（菌種鑒定），還可應(yīng)用于基因組單倍體分型（Phasing）、基因組結(jié)構(gòu)變異、新物種全基因組de novo組裝等多個(gè)方向。
丨細(xì)菌基因組完成圖-NGS躍級(jí)版，揭示細(xì)菌基因組完整面貌
細(xì)菌基因組完成圖-NGS躍級(jí)版通過(guò)基于TELL-Seq的二代測(cè)序技術(shù)以真邁生物的GenoLab M為載體，對(duì)細(xì)菌基因組進(jìn)行測(cè)序，實(shí)現(xiàn)高性價(jià)比的基因組完成圖組裝，獲得高準(zhǔn)確度的基因組信息。
丨卓越效果，眼見(jiàn)為實(shí)
TELL-Seq技術(shù)的測(cè)序數(shù)據(jù)可以組裝出接近完美的細(xì)菌基因組
樣本要求及檢測(cè)周期：
送樣要求：≥50ng，片段長(zhǎng)度＞20kb，未經(jīng)反復(fù)凍融，無(wú)降解，無(wú)污染
運(yùn)輸要求：-80℃保存，干冰運(yùn)輸
檢測(cè)周期：最短3周（收到樣本至交付組裝結(jié)果）
交付結(jié)果：DNA質(zhì)檢報(bào)告、測(cè)序下機(jī)原始數(shù)據(jù)、組裝結(jié)果
關(guān)于GenoLab M
GenoLab M是一款精準(zhǔn)、高效、靈活、開(kāi)放的桌面型高通量基因測(cè)序平臺(tái)，其采用基于芯片擴(kuò)增的表面熒光測(cè)序技術(shù)SURFSeq對(duì)堿基的熒光信號(hào)進(jìn)行識(shí)別，實(shí)現(xiàn)邊合成邊測(cè)序。GenoLab M可以兼容目前市面上主流的NGS文庫(kù)制備產(chǎn)品和數(shù)據(jù)分析流程。
相較于目前市場(chǎng)上的同類競(jìng)品，GenoLab M在擁有雙芯片平臺(tái)的基礎(chǔ)上，還支持'滾動(dòng)上機(jī)'模式，“滾動(dòng)上機(jī)”是指GenoLab M在運(yùn)行單側(cè)芯片平臺(tái)測(cè)序時(shí)，用戶可根據(jù)實(shí)際實(shí)驗(yàn)需求隨時(shí)啟動(dòng)空閑芯片平臺(tái)的測(cè)試工作，“雙芯片平臺(tái)+滾動(dòng)上機(jī)模式”極大地提高了GenoLab M的檢測(cè)靈活性，為用戶帶來(lái)了優(yōu)秀的使用體驗(yàn)。
參考文獻(xiàn)：
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