高質(zhì)量文庫：單鏈建庫技術(shù)，先轉(zhuǎn)化后加接頭，確保文庫高度完整性和優(yōu)異的測序質(zhì)量。
高轉(zhuǎn)化率：轉(zhuǎn)化率>99%，并保持樣本和批次間的高度穩(wěn)定。
甲基化高保真：基于專利酶轉(zhuǎn)全基因組甲基化測序（酶轉(zhuǎn)WGMS）技術(shù)，達到cfDNA插入片段上的甲基化從頭至尾高保真效果。
更多的甲基化位點：酶轉(zhuǎn)WGMS比全基因組亞硫酸氫鹽測序（鹽轉(zhuǎn)WGBS）檢測到更多CpG位點并獲得更高的有效覆蓋深度。
低DNA起始量：DNA起始量可低至1ng，可獲得穩(wěn)定的文庫和測序數(shù)據(jù)產(chǎn)出，以及穩(wěn)定的轉(zhuǎn)化率和保護率。
FASTASeq?300測序儀已實現(xiàn)“甲基化0%平衡文庫摻入”高質(zhì)量測序，這意味著在不摻入專用平衡文庫的條件下，F(xiàn)ASTASeq 300依然能夠提供高質(zhì)量的測序數(shù)據(jù)。在0%PhiX平衡文庫摻入的條件下，Q30均值≥92%、單index測序數(shù)據(jù)拆分率均值≥98%，與跟堿基平衡文庫混合測序的進口測序平臺數(shù)據(jù)表現(xiàn)相當(dāng)。
FASTASeq 300整體特點如下：
極致靈活——靈活應(yīng)對各種應(yīng)用場景4種芯片規(guī)格，支持SE50-PE300/SE400多種讀長
支持自定義數(shù)據(jù)輸出節(jié)點
極速交付——高質(zhì)量數(shù)據(jù)快速交付當(dāng)前傳統(tǒng)酶轉(zhuǎn)甲基化建庫技術(shù)運用在cfDNA上時，會出現(xiàn)越靠近插入片段3'端的平均甲基化率越下降的缺陷。竹石生物的酶轉(zhuǎn)建庫方法采用優(yōu)化后的專利建庫流程和酶轉(zhuǎn)反應(yīng)體系，確保了cfDNA片段從頭到尾都保持一致的甲基化率，實現(xiàn)了甲基化狀態(tài)的高保真。
Reads各位置的甲基化率
竹石生物酶轉(zhuǎn)WGMS相比傳統(tǒng)鹽轉(zhuǎn)WGBS，在相同測序量下對基因組不同區(qū)域的覆蓋深度更加均勻，并能覆蓋到更多的CpG位點。在相同測序量下，酶轉(zhuǎn)WGMS檢測到的CpG位點數(shù)比鹽轉(zhuǎn)WGBS多10%~20%左右，尤其在CpG島、啟動子區(qū)等GC富含區(qū)優(yōu)勢明顯。對全基因組以及甲基化檢測的重點區(qū)域的有效覆蓋深度，酶轉(zhuǎn)WGMS也遠超WGBS。
基因組不同GC含量區(qū)域的有效覆蓋深度
具有不同覆蓋深度的CpG位點數(shù)量分布
測序數(shù)據(jù)中的Duplication可能來自建庫過程中的PCR擴增以及測序過程中的光學(xué)重復(fù)。在將測序Reads比對到參考基因組之后，這些Duplication reads會作為冗余數(shù)據(jù)被去除掉。該甲基化整體解決方案顯示，在相同文庫相同測序量的情況下，真邁生物FASTASeq 300測序儀的Duplication rate顯著低于A公司的競品測序儀結(jié)果，可以獲得更多的有效數(shù)據(jù)量。
Duplication rate對比
FASTASeq?300測序儀靈活的測序策略、用戶友好及高度自動化的測序操作、快速的測序速度等特性表現(xiàn)突出，為用戶節(jié)省了項目周轉(zhuǎn)時間，減少了操作失誤，深得竹石生物用戶的認可。竹石生物已基于真邁生物測序平臺面向高校、科研院所和企業(yè)開展了多物種各種樣本類型的甲基化測序、擴增子測序等科技服務(wù)。相信竹石生物與真邁生物的合作，將為甲基化研究帶來新的視角和工具。