SureSelect人全外顯子V8建立在10多年歷史的成熟的 SureSelect 技術(shù)之上，采用基于機(jī)器學(xué)習(xí)的探針設(shè)計(jì)，全面覆蓋RefSeq、CCDS和GENCODE蛋白質(zhì)編碼區(qū)域。V8的設(shè)計(jì)大小僅為41.6 Mb，卻能覆蓋人類基因組35.1 Mb的靶標(biāo)區(qū)域，提供高效且經(jīng)濟(jì)的外顯子組測序。
V8能夠在典型測序深度提供更廣泛的靶標(biāo)覆蓋，并具有更深的中位覆蓋率，可實(shí)現(xiàn)更可靠的變異檢測。V8覆蓋了TERT啟動(dòng)子和市場上其他外顯子組中忽略的難以捕獲的外顯子，還通過大規(guī)模生產(chǎn)分裝，確保數(shù)年內(nèi)提供一致的結(jié)果。
真邁生物測序平臺(tái)采用高靈敏度、高分辨率光學(xué)系統(tǒng)，實(shí)現(xiàn)毫秒級(jí)高速對(duì)焦，實(shí)現(xiàn)對(duì)高密度熒光信號(hào)的分辨和采集。尤其是SURFSeq 5000高通量基因測序平臺(tái)，基于機(jī)器學(xué)習(xí)的多維堿基識(shí)別算法，極大地提升了測序精準(zhǔn)度，使測序錯(cuò)誤率降至萬分之五水平（Q40 ≥?90%）。真邁生物測序平臺(tái)在保證測序質(zhì)量的同時(shí)，提供極具競爭力的測序成本。
通過整合安捷倫經(jīng)典的V8和真邁生物高性能基因測序平臺(tái)，使得該整體解決方案在測序質(zhì)量、基因組覆蓋率、基因組比對(duì)率、中靶率、數(shù)據(jù)重復(fù)率、變異位點(diǎn)檢測等關(guān)鍵性能指標(biāo)上均達(dá)到了高標(biāo)準(zhǔn)。安捷倫V8捕獲建庫試劑盒與真邁生物測序平臺(tái)組合使用，能夠進(jìn)一步提升測序的準(zhǔn)確性和效率，為用戶提供一套可靠的人全外顯子組測序方案。
圖1 安捷倫&真邁生物人全外顯子整體解決方案
整體解決方案的數(shù)據(jù)表現(xiàn)
基于V8構(gòu)建了4個(gè)文庫，每個(gè)文庫都分別在真邁FASTASeq 300、GenoLab M、SURFSeq 5000高通量基因測序平臺(tái)和A司高通量基因測序平臺(tái)上進(jìn)行測序和數(shù)據(jù)分析。測序結(jié)果表明：真邁3款高通量測序平臺(tái)和A司高通量基因測序平臺(tái)下機(jī)數(shù)據(jù)Q30均超過93%，確保了測序結(jié)果的準(zhǔn)確性和可靠性。
注：S1、S2、S3、S4代表四個(gè)gDNA樣本
圖2 數(shù)據(jù)質(zhì)量分析
重要測序參數(shù)表現(xiàn)優(yōu)異
方案的重要參數(shù)表現(xiàn)優(yōu)異：基因組比對(duì)率接近100%，中靶率超過86%，1X目標(biāo)區(qū)域覆蓋率超過99.6%，10X接近99.2%，30X超過97.7%。另外，真邁生物測序平臺(tái)的Duplicate ratio更低，意味著其產(chǎn)生的數(shù)據(jù)中重復(fù)信息更少，從而提供了更高的有效數(shù)據(jù)。
圖3&4 重要測序參數(shù)表現(xiàn)
方案中真邁不同測序平臺(tái)FASTASeq 300（FA）、GenoLab M（GL）及SURFSeq 5000（SF）與A司測序平臺(tái)檢測SNV/InDel的一致性均超過98.2%，展現(xiàn)出了非常高的一致性，確保了變異位點(diǎn)檢測的準(zhǔn)確性和可靠性。
圖5?測序平臺(tái)間變異位點(diǎn)檢測的一致性
安捷倫與真邁生物合作開發(fā)的人全外顯子測序整體解決方案，展示了安捷倫SureSelect V8捕獲建庫試劑盒與真邁生物高通量基因測序平臺(tái)產(chǎn)品組合應(yīng)用的優(yōu)異性能。真邁生物期待與行業(yè)內(nèi)合作伙伴共同打造基因測序平臺(tái)應(yīng)用生態(tài)聯(lián)盟，充分發(fā)揮各方優(yōu)勢，為廣大用戶提供高效、可靠的一站式全方位的解決方案，共同推動(dòng)基因測序行業(yè)的創(chuàng)新與發(fā)展。